У Археолошкој збирци чува се документација и покретни археолошки материјал са више налазишта:

ЛЕПЕНСКИ ВИР – део документације и материјала који потичу са археолошких истраживања академика Драгослава Срејовића обављених у периоду од 1965. до 1970. године;

ВЛАСАЦ – документација и материјал који потичу са археолошких ископавања обављених током 1970. и 1971. године;

ВИНЧА – целокупна документација и материјал који потичу са ископавања професора Милоја М. Васића обављених у периоду од 1929. до 1934. године;

ЖИДОВАР – документација и материјал који потичу са ископавања професора Бранка Гавеле у периоду од 1948. до 1977. године;

РАС – ПОСТЕЊЕ – документација и материјал који потичу са ископавања којима руководи мр Душан Мркобрад, а која од 1975. године, са мањим прекидима, трају и данас.

Поред покретног археолошког материјала који припада фундусу Збирке, у њој се данас чува и материјал са преко 50 археолошких налазишта у Србији и Црној Гори.