Институт за филозофију је 1967. године као засебну организациону јединицу Факултета основао проф. др Михаило Марковић. Статус научне јединице Филозофског факултета стекао је 1970. године. Данас Институт своју делатност обавља при Одељењу за филозофију, са којим остварује уску сарадњу кроз учешће наставника и сарадника Одељења на пројекту Проблем експланаторног јаза у филозофији и науци.

Управник Института је проф. др Живан Лазовић.